本文为杨站长技术团队制作的《Materials Studio入门手册》第12篇,本教程旨在从零开始带大家入门MS软件,文末可下载更多学习资料。
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MS入门手册(1):Materials Studio全模块功能介绍!
MS入门手册(2):量子力学、分子力学、介观模拟方法,各模块重点介绍!
MS入门手册(3):Materials Studio软件中所有的输入输出文件及其作用
MS入门手册(5):Materials Studio制作高质量科技论文图片!
MS入门手册(6):Materials Studio制作清晰形象的动画,生动演示分子动力学过程
MS入门手册(7):3分钟学会催化/电池等领域的MXene结构的建模方法!
MS入门手册(8):Materials Studio导入晶体结构和调整显示方式
MS入门手册(9):Materials Studio建模之原胞与晶胞的小知识
MS入门手册(10):Materials Studio从无到有建立晶体结构
MS入门手册(11):Materials Studio晶体结构点缺陷建模:无序固溶体
大家好,今天我们接着说点缺陷,对上次提出的课后问题“金红石(TiO2)的一半Ti4+离子变成了Ti3+离子”进行说明。首先我们导入晶体文件,可以回顾一下之前的课程,金红石相TiO2晶体结构文件的路径为Structure—metal-oxides—TiO2_rutile.msi,另外还有两个文件TiO2_anatase代表锐钛矿,TiO2_brookite代表板钛矿,是TiO2晶体的三种同质多象。可以把这三种不同晶体结构的TiO2晶体文件都打开,比较一下它们的区别。
有小伙伴可能要问了,为什么这三个窗口可以垂直排列呢?(如果想要问其他显示问题的,可以再回顾一下之前的教程)可以用Window菜单下的功能实现对于窗口的各种平铺和层叠排列,当然如果窗口太多了也可以用close一键关闭,再打开自己需要的窗口。现在我们就关闭其他两个窗口,只对金红石相进行操作,关闭的时候会提示我们是否要保存,如果刚刚导入文件从来没有保存过,又选择了No,你就会发现这个文件从Project里消失了。为了避免这样的问题,我们要养成随时保存的好习惯,如果窗口的标题栏上带着“*”,就说明这个窗口中的内容没有保存。每个文件都单独保存太麻烦,我们又一个方法可以保存整个project中所有没有保存的内容,大家有没有感兴趣呢?大家还记得怎么调整各种显示区和快捷工具栏工具的显示问题吗?用View菜单就可以啦,View—Toolbars—Project,您就会发现出现了两个小抽屉,一个是打开project,一个是保存project,用小抽屉管理文件是不是很形象呢?当然我们还有一个方式能够实现这个功能,File菜单中也是又这个小抽屉的,实际上快捷工具栏里的各种工具基本上都可以在菜单里不同的位置找到,快捷工具栏只不过是把一些比较常用的工具集中在一起,方便我们进行使用而已,和各种其他软件都是相似的现在我们再来看这个金红石相,它属于四方晶系,a=b≠c,三个夹角均为90°,properties区域可以显示出它的详细晶体数据以及空间群等信息。所有的Ti原子处于同一环境,所以只选中一个Ti原子就可以对它进行设置。我们选中其中一个Ti原子,在properties区域,可以双击Composition后面的Ti,或者IsMixtureAtom后面的No,都可以打开杂化原子编辑对话框。这次我们的两个成分不再是不同的元素,而是同一个元素的不同化合态,这可以实现吗?当然可以,当我们使用Edit按钮进行已有元素的编辑或者Add按钮添加新的元素时,都会有一个氧化态(Oxidation state)的选项。在这里我们就可以调整所需元素的价态(-5~+8)。我们结合这个功能和上节课所使用到的元素设置,就可以得到“金红石(TiO2)的一半Ti4+离子变成了Ti3+离子”的效果了。一半Ti4+离子和一半Ti3+离子组成的金红石(TiO2)结构今天我们的课程中对于IsMixtureAtom(Composition)的问题进行了进一步深入的分析,下次我们将继续探索点缺陷,对空位的建模方式进行介绍,说实话我已经迫不及待啦。我现在就去把下一讲的教程写完,不过推送的话也许大家还要耐心等待哦,期待我们下一次继续分享MS的使用方法。《MS入门手册》针对完全零基础的学员设计,约100篇文章,紧跟杨站长,学会计算,拿下顶刊!配合杨老师录制的MS视频食用,效果更佳!共120+视频,关注量10000,包含建模与计算特训营(长)+官方教程指导(长)+新手避坑指南100讲(短),并依大家需求不断更新。3分钟解决一个计算难题,1小时搞定一张SCI插图!扫描下方二维码或点击B站链接:https://space.bilibili.com/669166168同时杨站长提供了大量学习资料,大家可以学习和下载,包括官方手册以及对应视频教程等。
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